Kyrkan är byggd i tre etapper under 1200-talet, men uppvisar harmoniska proportioner.
Apostlabilderna (till viss del övermålade på 1400-talet av "Passionsmästaren") samt figurerna på triumfbågsväggen från 1200-talet av "Mikaelsmästaren".
Hejdeby kyrka kallas ibland "rosornas kyrka" beroende på den rika bänkdekoren men efter restaureringen i början på 1970-talet kan den väl också kallas apostlarnas kyrka, ty stora apostlamålningar finns i hela kyrkan.
Triumfkrucifix 1200-tal. Det brukar sägas att det var först gotiken som började spika fast fötterna direkt på korset, i Hejdeby kyrka både står han på en platta och är därtill fastspikad.